RNA–Protein interactions for RNA: YKR063C

LAS1, Transcript of Protein required for pre-rRNA processing at both ends of ITS2, yeast

Gene LAS1, Length 1,509 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LAS1	YKR063C	APL2	P36000	726 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	YKR075C	P36155	307 aa		5	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	SPT20	P50875	604 aa		5	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	5	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	MCD1	Q12158	566 aa		5	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	PCT1	P13259	424 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	FYV10	P40492	516 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	VPS53	P47061	822 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	ROD1	Q02805	837 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	PDR18	P53756	1333 aa		4.99	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	KIP1	P28742	1111 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	ALG3	P38179	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	MGE1	P38523	228 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	GPB2	P39717	880 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	YJR107W	P47145	328 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	MLC1	P53141	149 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	PTC5	Q12511	572 aa		4.98	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	YSC84	P32793	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	MDL2	P33311	773 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	VPS24	P36095	224 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	BRN1	P38170	754 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	YGL082W	P53155	381 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	BRE1	Q07457	700 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	AIM26	P32858	118 aa		4.97	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
LAS1	YKR063C	UTP10	P42945	1769 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	NOT3	P06102	836 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	GCR1	P07261	785 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	HXT13	P39924	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	GNP1	P48813	663 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	YGL242C	P53066	181 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	SUN4	P53616	420 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	HXT17	P53631	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	HXT15	P54854	567 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	TPM1	P17536	199 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	CLC1	P17891	233 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	HEM3	P28789	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	SIW14	P53965	281 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	FCP1	Q03254	732 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	RMD1	Q03441	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	MRL1	Q06815	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	BUG1	Q12191	341 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	NYV1	Q12255	253 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	TAF13	P11747	167 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	MKK2	P32491	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	SEC8	P32855	1065 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
LAS1	YKR063C	RSC58	Q07979	502 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	SAC3	P46674	1301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	RAD53	P22216	821 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	NPR2	P39923	615 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	KRI1	P42846	591 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	GCN5	Q03330	439 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	YOR352W	Q08816	343 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	RIM20	Q12033	661 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	PEP7	P32609	515 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	MEF2	P39677	819 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	DJP1	P40564	432 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	MRPS35	P53292	345 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	COG8	Q04632	607 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	SPO21	Q12411	609 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	ROX1	P25042	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	PBY1	P38254	753 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	OSH3	P38713	996 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	LAM1	P38851	1228 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	YFL054C	P43549	646 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	SGD1	Q06132	899 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	RRI2	Q12348	645 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	SNF5	P18480	905 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	MSP1	P28737	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	BAP2	P38084	609 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	TNA1	P53322	534 aa		4.91	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	OYE2	Q03558	400 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
LAS1	YKR063C	ADR1	P07248	1323 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	PIF1	P07271	859 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	SPS1	P08458	490 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	BIK1	P11709	440 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	HCM1	P25364	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	SPO22	P40511	975 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	UBP16	Q02863	499 aa		4.9	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	ESF1	Q06344	628 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
LAS1	YKR063C	CTI6	Q08923	506 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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