RNA–Protein interactions for RNA: YJL113W

YJL113W, Transcript of Retrotransposon TYA Gag and TYB Pol genes, yeastyeast

Gene YJL113W, Length 4,647 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YJL113WYJL113W RME1P32338 300 aaKnown RBP-0□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W CUE2P36075 443 aaKnown RBP-0□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SUL1P38359 859 aa-0□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W KSP1P38691 1029 aaKnown RBP-0□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W NET1P47035 1189 aa-0□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W VTC4P47075 721 aa-0□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YNL050CP53952 270 aa-0□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W PEX13P80667 386 aa-0□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SIZ1Q04195 904 aa-0□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W ORM2Q06144 216 aa-0□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W COQ4O13525 335 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YKL133CP36066 463 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W CTK1Q03957 528 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W FUS2Q05670 677 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SRO7Q12038 1033 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W TSR4P25040 408 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W PAM1P37304 830 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YPT35P38815 214 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W FHL1P39521 936 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YJL043WP47053 257 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W ASI1P54074 624 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W CDA2Q06703 312 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W AIM39Q08223 395 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W GAL4P04386 881 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W LEU1P07264 779 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SPC42P36094 363 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W FAR11P53917 953 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W PNG1Q02890 363 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W HEH2Q03281 663 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W PPM1Q04081 328 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W CAN1P04817 590 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SRD1P09007 221 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W LPD1P09624 499 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SRS2P12954 1174 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W CTS1P29029 562 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W MRPL9P31334 269 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W CDC11P32458 415 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SEF1P34228 1148 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W STM1P39015 273 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W BFA1P47113 574 aa-0.01□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W ORC2P32833 620 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W FTH1P38310 465 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W LEO1P38439 464 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W GUA1P38625 525 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W ALT2P52892 507 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W IRC10Q08118 586 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W BLM10P43583 2143 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W POL2P21951 2222 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data-0.02□□□□□ -2.41not detected
YJL113WYJL113W RSC30P38781 883 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W TAF8Q03750 510 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SPO71Q03868 1245 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YDL177CQ12257 170 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YDR524C-BQ3E6R4 66 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W HRR25P29295 494 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W MSS51P32335 436 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W MRP4P32902 394 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W HIS7P33734 552 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SHP1P34223 423 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YFL034WP43564 1073 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W IRC15Q02733 499 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W RBA50Q04418 439 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YDL057WQ07379 328 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W RPS9AO13516 197 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W AAT2P23542 418 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SFA1P32771 386 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W ITC1P53125 1264 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W IPI3P53877 555 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YOL057WQ08225 711 aa-0.02□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W LEU2P04173 364 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W RPB10P22139 70 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W PRD1P25375 712 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W GEM1P39722 662 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W GAT1P43574 510 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W RIM8P53179 542 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W ARK1P53974 638 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YPL014WQ02606 381 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W ROD1Q02805 837 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YDR131CQ03899 556 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W GYL1Q04322 720 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YLR407WQ06070 228 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W FRE7Q12333 620 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W TEF1P02994 458 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W TRL1P09880 827 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W HOS4P40480 1083 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SNG1P46950 547 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W RSM26P47141 266 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W LCL3P53153 274 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W YOL073CQ08232 322 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W TIF6Q12522 245 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W GLN3P18494 730 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W PFS1P38872 237 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W VPS4P52917 437 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W RTT109Q07794 436 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SPE3Q12074 293 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W APC11Q12157 165 aa-0.03□□□□□ -2.41
YJL113WYJL113W SPT2P06843 333 aaPredicted RBP-0.04□□□□□ -2.42
YJL113WYJL113W SRV2P17555 526 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
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