RNA–Protein interactions for RNA: YGR248W

SOL4, Transcript of 6-phosphogluconolactonase, yeast

Gene SOL4, Length 768 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SOL4	YGR248W	GDT1	P38301	280 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	RTT107	P38850	1070 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.66	□□□□□ -1.66	not detected
SOL4	YGR248W	CAJ1	P39101	391 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	YGL140C	P53120	1219 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	MRS2	Q01926	470 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	GYL1	Q04322	720 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	RBA50	Q04418	439 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	SML1	Q04964	104 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	EST2	Q06163	884 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	TAH18	Q12181	623 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	ENT1	Q12518	454 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	DFG16	Q99234	619 aa		4.66	□□□□□ -1.66
SOL4	YGR248W	CDC6	P09119	513 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	CBP3	P21560	335 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	VPS1	P21576	704 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	URA1	P28272	314 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SEC65	P29478	273 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	STO1	P34160	861 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SEG2	P34250	1132 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	LRG1	P35688	1017 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	PXL1	P36166	706 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	YHL008C	P38750	627 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SEC9	P40357	651 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	NDC80	P40460	691 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	OYE3	P41816	400 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	ALT1	P52893	592 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	RNT1	Q02555	471 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SPN1	Q06505	410 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	PPM2	Q08282	695 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	AFT2	Q08957	416 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	ATG9	Q12142	997 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	MNL2	Q12205	849 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	YOL098C	Q12496	1037 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	RIM15	P43565	1770 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	RPL22A	P05749	121 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SSA1	P10591	642 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	COQ1	P18900	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	RNQ1	P25367	405 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	DPB3	P27344	201 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SAP190	P36123	1033 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	NUT1	P53114	1132 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	ORC3	P54790	616 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	YMR102C	Q03177	834 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	VPS38	Q05919	439 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	ADR1	P07248	1323 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	ADP1	P25371	1049 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	RRP1	P35178	278 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	YET1	P35723	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	MED8	P38304	223 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SPT8	P38915	602 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	CCC2	P38995	1004 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	ECM1	P39715	212 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	IRC8	P47046	822 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	ALF1	P53904	254 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	YAF9	P53930	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	HDA1	P53973	706 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SAC3	P46674	1301 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	CDC37	P06101	506 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	PIF1	P07271	859 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	RPO26	P20435	155 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	HSP78	P33416	811 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SLD2	P34252	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	NNK1	P36003	928 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	GRX7	P38068	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	RGD1	P38339	666 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SHU2	P38957	223 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	DSN1	P40568	576 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	YGR237C	P50089	785 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	MAL13	P53338	473 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	BOP3	P53958	396 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	MMR1	Q06324	491 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	PTC5	Q12511	572 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	YOL087C	Q99247	1116 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	POM152	P39685	1337 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	NFS1	P25374	497 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SOL4	YGR248W	CDC3	P32457	520 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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