RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)G2

tK(UUU)G2, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)G2, Length 73 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RGP1P16664 663 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 VPS1P21576 704 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SPT5P27692 1063 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 BMH1P29311 267 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 NAM7P30771 971 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 MRF1P30775 413 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SEC21P32074 935 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 BIO2P32451 375 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 TMT1P32643 299 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 PRX1P34227 261 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SIP3P38717 1229 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YHR202WP38887 602 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 FMP10P40098 244 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 OPT1P40897 799 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 BFA1P47113 574 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CTR1P49573 406 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 UBA2P52488 636 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RTT102P53330 157 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 DOT1Q04089 582 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 IES4Q08561 116 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 TSR3Q12094 313 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 MYO1P08964 1928 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YMR084WA2P2R3 262 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CPA2P03965 1118 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 PFK1P16861 987 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ADE2P21264 571 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RSA4P25382 515 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 VPH1P32563 840 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YKL023WP36103 277 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 PET10P36139 283 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SSB2P40150 613 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.61□□□□□ -1.83not detected
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CUE3P53137 624 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YGL081WP53156 320 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 VPS20Q04272 221 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YML083CQ04526 418 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 COG8Q04632 607 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ESC8Q08119 714 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 DAP1Q12091 152 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SGT2Q12118 346 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 TFC8Q12308 588 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 VPS13Q07878 3144 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RPS9AO13516 197 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 HIS4P00815 799 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 HAP2P06774 265 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ISY1P21374 235 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RDS1P25611 832 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 COQ8P27697 501 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RAD54P32863 898 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 MNR2P35724 969 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RFT1P38206 574 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 MMS4P38257 691 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 UBX7P38349 436 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 PIH1P38768 344 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YHR131CP38835 850 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CCM1P48237 864 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 GUP1P53154 560 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CUL3P53202 744 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YNL146WP53906 100 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 VTC3Q02725 835 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YDR090CQ03193 310 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 UTP14Q04500 899 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 MRI1Q06489 411 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RAD59Q12223 238 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 PTC5Q12511 572 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.83not detected
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ATP1P07251 545 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YEL076C-AP0CX16 216 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YLR464WP0CX17 216 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 PHO8P11491 566 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 NAT1P12945 854 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 GLN3P18494 730 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 VPS3P23643 1011 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.83not detected
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CAD1P24813 409 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ADK2P26364 225 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 HIR1P32479 840 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YSC83P32792 385 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ELM1P32801 640 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CSE2P33308 149 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 KDX1P36005 433 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YKT6P36015 200 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 MNN4P36044 1178 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 CTM1P38818 585 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 XDJ1P39102 459 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YEL076CP39971 216 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YEL023CP39992 682 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 RSM25P40496 264 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 HYR1P40581 163 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 HUL4P40985 892 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 BRE2P43132 505 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 COS5P47187 383 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YGR153WP48238 217 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 TOF1P53840 1238 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 ALG11P53954 548 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)G2tK(UUU)G2 YNL034WP53963 612 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 42.8 ms