RNA–Protein interactions for RNA: tK(UUU)D

tK(UUU)D, Transcript of Lysine tRNA (tRNA-Lys), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tK(UUU)D, Length 73 nt, Biotype tRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tK(UUU)DtK(UUU)D RGP1P16664 663 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D VPS1P21576 704 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D SPT5P27692 1063 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D BMH1P29311 267 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D NAM7P30771 971 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D MRF1P30775 413 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D SEC21P32074 935 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D BIO2P32451 375 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D TMT1P32643 299 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D PRX1P34227 261 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D SIP3P38717 1229 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YHR202WP38887 602 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D FMP10P40098 244 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D OPT1P40897 799 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D BFA1P47113 574 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D CTR1P49573 406 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D UBA2P52488 636 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D CAF130P53280 1122 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D RTT102P53330 157 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D DOT1Q04089 582 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D IES4Q08561 116 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D TSR3Q12094 313 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D MYO1P08964 1928 aa3.62□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YMR084WA2P2R3 262 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D CPA2P03965 1118 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D SSB1P11484 613 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D PFK1P16861 987 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D ADE2P21264 571 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D RSA4P25382 515 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D VPH1P32563 840 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YKL023WP36103 277 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D PET10P36139 283 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D SSB2P40150 613 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D SCD6P45978 349 aaKnown RBP RIP-Chip data3.61□□□□□ -1.83not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D CUE3P53137 624 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YGL081WP53156 320 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D VPS20Q04272 221 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YML083CQ04526 418 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D COG8Q04632 607 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D ESC8Q08119 714 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D DAP1Q12091 152 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D SGT2Q12118 346 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D TFC8Q12308 588 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D VPS13Q07878 3144 aa3.61□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D RPS9AO13516 197 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D HIS4P00815 799 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D HAP2P06774 265 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D ISY1P21374 235 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D RDS1P25611 832 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D COQ8P27697 501 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D RAD54P32863 898 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D MNR2P35724 969 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D RFT1P38206 574 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D MMS4P38257 691 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D UBX7P38349 436 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D PIH1P38768 344 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YHR131CP38835 850 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D ULP2P40537 1034 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D CCM1P48237 864 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D GUP1P53154 560 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D CUL3P53202 744 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YNL146WP53906 100 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D VTC3Q02725 835 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YDR090CQ03193 310 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D UTP14Q04500 899 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D MRI1Q06489 411 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D RAD59Q12223 238 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D PTC5Q12511 572 aa3.6□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D SCP160P06105 1222 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.83not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D ATP1P07251 545 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YEL076C-AP0CX16 216 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YLR464WP0CX17 216 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D PHO8P11491 566 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D NAT1P12945 854 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D GLN3P18494 730 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D VPS3P23643 1011 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.59□□□□□ -1.83not detected
tK(UUU)DtK(UUU)D CAD1P24813 409 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D ADK2P26364 225 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D HIR1P32479 840 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YSC83P32792 385 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D ELM1P32801 640 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D CSE2P33308 149 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D KDX1P36005 433 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YKT6P36015 200 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D MNN4P36044 1178 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D SHE3P38272 425 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D CTM1P38818 585 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D XDJ1P39102 459 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YEL076CP39971 216 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YEL023CP39992 682 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D RSM25P40496 264 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D HYR1P40581 163 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D HUL4P40985 892 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D BRE2P43132 505 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D COS5P47187 383 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YGR153WP48238 217 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D TOF1P53840 1238 aa3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D ALG11P53954 548 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
tK(UUU)DtK(UUU)D YNL034WP53963 612 aa3.59□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 89.6 ms