RNA–Protein interactions for RNA: YPL093W

NOG1, Transcript of Putative GTPase, yeast

Gene NOG1, Length 1,944 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NOG1	YPL093W	TOF1	P53840	1238 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	MET7	Q08645	548 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	YLL058W	Q12198	575 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	SPO11	P23179	398 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	APL1	P27351	700 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	SEC65	P29478	273 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	YSC83	P32792	385 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	RPC25	P35718	212 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	PAM1	P37304	830 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	MXR1	P40029	184 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	SMC3	P47037	1230 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	COS5	P47187	383 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	CTR1	P49573	406 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	YOL075C	Q08234	1294 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	TRM11	Q12463	433 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	SWI6	P09959	803 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	MNN4	P36044	1178 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	STU2	P46675	888 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	YLR287C	Q05881	355 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	YDL057W	Q07379	328 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	SPO75	Q07798	868 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	PLP2	Q12017	286 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NOG1	YPL093W	RPS6A	P0CX37	236 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	RPS6B	P0CX38	236 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.09	□□□□□ -1.76	not detected
NOG1	YPL093W	DAL7	P21826	554 aa		4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	MNR2	P35724	969 aa		4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	GPT2	P36148	743 aa		4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	EFM2	P38347	419 aa		4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	CTR9	P89105	1077 aa		4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	YMR321C	Q04898	105 aa		4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	GPI13	Q07830	1017 aa		4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	HMI1	Q12039	706 aa		4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
NOG1	YPL093W	YUR1	P26725	428 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	PGM2	P37012	569 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	RTT107	P38850	1070 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	EAF5	P39995	279 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	VFA1	P40080	203 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	OSW7	P43611	510 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	STR2	P47164	639 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	ARK1	P53974	638 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	ROD1	Q02805	837 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	DON1	Q05610	365 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	OPY2	Q06810	360 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	YPR078C	Q06813	372 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	MLH2	Q07980	695 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	APL4	Q12028	832 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	ICL2	Q12031	575 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	HFI1	Q12060	488 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	ATG9	Q12142	997 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	OSW2	Q12202	724 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	SRF1	Q12516	437 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	POX1	P13711	748 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	CHS2	P14180	963 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	VMA1	P17255	1071 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	MRM1	P25270	412 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	TRK2	P28584	889 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	IRE1	P32361	1115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	COT1	P32798	439 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	NIP100	P33420	868 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	KTR2	P33550	425 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	YEL1	P34225	687 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	PXL1	P36166	706 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	SHM1	P37292	490 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
NOG1	YPL093W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	RTT102	P53330	157 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	ALF1	P53904	254 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	TIM8	P57744	87 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	COQ9	Q05779	260 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	VPS38	Q05919	439 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	HIF1	Q12373	385 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	MOT1	P32333	1867 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	RIF1	P29539	1916 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	MAS2	P11914	482 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	SNA3	P14359	133 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	YGL015C	P33199	130 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NOG1	YPL093W	XRS2	P33301	854 aa		4.07	□□□□□ -1.76

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