RNA–Protein interactions for RNA: YOL052C-A

DDR2, Transcript of Multi-stress response protein, yeast

Gene DDR2, Length 186 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	YOL052C-A	ARK1	P53974	638 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	YMR321C	Q04898	105 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	SPO75	Q07798	868 aa		11.93	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	PHO8	P11491	566 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	RME1	P32338	300 aa	Known RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	YSC83	P32792	385 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	11.92	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	CTR9	P89105	1077 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	MET7	Q08645	548 aa		11.92	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.91	□□□□□ -0.5	not detected
DDR2	YOL052C-A	YUR1	P26725	428 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	COT1	P32798	439 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	UBP5	P39944	805 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	11.91	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	ROD1	Q02805	837 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	YLR287C	Q05881	355 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	ATG9	Q12142	997 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	SRF1	Q12516	437 aa		11.91	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	RPC25	P35718	212 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	11.9	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	RLP24	Q07915	199 aa	Known RBP	11.9	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	HMI1	Q12039	706 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	YLL058W	Q12198	575 aa		11.9	□□□□□ -0.5
DDR2	YOL052C-A	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	11.89	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	MNN4	P36044	1178 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	RTT107	P38850	1070 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	VFA1	P40080	203 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	COS5	P47187	383 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	HFM1	P51979	1187 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	ALF1	P53904	254 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	COQ9	Q05779	260 aa		11.89	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	NOC3	Q07896	663 aa	Predicted RBP	11.89	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	YEL1	P34225	687 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	MNR2	P35724	969 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	FIG4	P42837	879 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	GPI13	Q07830	1017 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	APL4	Q12028	832 aa		11.88	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	CWC2	Q12046	339 aa	Predicted RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	11.88	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	SWI6	P09959	803 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	YAP5	P40574	245 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	VPS38	Q05919	439 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	NCR1	Q12200	1170 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	OSW2	Q12202	724 aa		11.87	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	EFT1	P32324	842 aa	Known RBP	11.86	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	KTR2	P33550	425 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	LCB2	P40970	561 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	SMC3	P47037	1230 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	JSN1	P47135	1091 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.86	□□□□□ -0.51	not detected
DDR2	YOL052C-A	YML020W	Q03722	664 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	DON1	Q05610	365 aa		11.86	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.85	□□□□□ -0.51	not detected
DDR2	YOL052C-A	POX1	P13711	748 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	EAF5	P39995	279 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	PSP2	P50109	593 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	SHE10	P53075	577 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	TAM41	P53230	385 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	RTT102	P53330	157 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	UME1	Q03010	460 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	IES4	Q08561	116 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	CDC53	Q12018	815 aa	Known RBP	11.85	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	ICL2	Q12031	575 aa		11.85	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	CHS2	P14180	963 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	KIN82	P25341	720 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	IRE1	P32361	1115 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	PCH2	P38126	564 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	ERC1	P38767	581 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	SDS3	P40505	327 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	AVT1	P47082	602 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	ERG5	P54781	538 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	UTP5	Q04177	643 aa	Known RBP	11.84	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	YLR297W	Q05899	129 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	MLH2	Q07980	695 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		11.84	□□□□□ -0.51
DDR2	YOL052C-A	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	GPT2	P36148	743 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	11.83	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	SCS3	P53012	380 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	TIM8	P57744	87 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	VTC3	Q02725	835 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	OPY2	Q06810	360 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	YPR078C	Q06813	372 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	HIF1	Q12373	385 aa		11.83	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	SEC23	P15303	768 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	SPO12	P17123	173 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	SSD1	P24276	1250 aa	Known RBP RIP-Chip data	11.82	□□□□□ -0.52	not detected
DDR2	YOL052C-A	DPH2	P32461	534 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	OSW7	P43611	510 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	JJJ3	P47138	172 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	NCS6	P53088	359 aa		11.82	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	DUS1	P53759	423 aa	Known RBP	11.82	□□□□□ -0.52
DDR2	YOL052C-A	HFI1	Q12060	488 aa		11.82	□□□□□ -0.52

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 96.1 ms