RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P YKE2P52553 114 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL138CP53122 345 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P MET13P53128 600 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR035CP53222 116 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P SDA1P53313 767 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P CNM67P53865 581 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P PGA2P53903 129 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM23Q02710 187 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P GDE1Q02979 1223 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YDR090CQ03193 310 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P OYE2Q03558 400 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YML020WQ03722 664 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P PHM6Q05637 104 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR455WQ06188 304 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YLH47Q06493 454 aa2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P SLK19Q08581 821 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P CIT2P08679 460 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P TRL1P09880 827 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P WHI2P12611 486 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P MSD1P15179 658 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P FRS2P15625 503 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P PPZ1P26570 692 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P RME1P32338 300 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P RFS1P38234 210 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P SLX1P38324 304 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P UBX7P38349 436 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P ERC1P38767 581 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P SPO22P40511 975 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YIR016WP40572 265 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P MGA2P40578 1113 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P BUD6P41697 788 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P OYE3P41816 400 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P MAF1P41910 395 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P BRE2P43132 505 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P LAM5P43560 674 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P AVT1P47082 602 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P ALT2P52892 507 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YNR014WP53719 212 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL134CP53912 376 aaKnown RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P CUS1Q02554 436 aaPredicted RBP2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P SKY1Q03656 742 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P SMC5Q08204 1093 aa2.95□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P TOM70P07213 617 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P THR4P16120 514 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX1P24004 1043 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P SIS1P25294 352 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P SRO9P25567 434 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P RAM2P29703 316 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC21P32074 935 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P EFT1P32324 842 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P OPY1P38271 328 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P APM2P38700 605 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YHL026CP38740 315 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P PIH1P38768 344 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P CCC2P38995 1004 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P STT3P39007 718 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P XDJ1P39102 459 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P FIS1P40515 155 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P CTF18P49956 741 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P STB4P50104 949 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P RET3P53600 189 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL034WP53963 612 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P FAP1P53971 965 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YNL018CP53976 612 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data2.94□□□□□ -1.94not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P MFM1Q02783 413 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P COQ9Q05779 260 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P MMR1Q06324 491 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P OSW2Q12202 724 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P HIF1Q12373 385 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P PCD1Q12524 340 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P SMC6Q12749 1114 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P NBL1Q3E7Y6 73 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM29P38737 1868 aa2.94□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P SNF1P06782 633 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P SRD1P09007 221 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P MATALPHA2P0CY08 210 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P HMLALPHA2P0CY09 210 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P TAF13P11747 167 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P DBP5P20449 482 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P RSA4P25382 515 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P COQ8P27697 501 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P TMT1P32643 299 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P PET10P36139 283 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P RFC5P38251 354 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P BUD16P39988 312 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P ESL1P40456 1118 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P FYV10P40492 516 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P JJJ3P47138 172 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P PIL1P53252 339 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P RTT102P53330 157 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P NCS2P53923 493 aaPredicted RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P ROD1Q02805 837 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P DOT1Q04089 582 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P ADY4Q05955 493 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P ESC8Q08119 714 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P HFI1Q12060 488 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR022CQ12204 715 aa2.93□□□□□ -1.94
tW(CCA)PtW(CCA)P PKH2Q12236 1081 aaKnown RBP2.93□□□□□ -1.94
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