RNA–Protein interactions for RNA: YGL064C

MRH4, Transcript of Mitochondrial ATP-dependent RNA helicase of the DEAD-box family, yeast

Gene MRH4, Length 1,686 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRH4	YGL064C	BAS1	P22035	811 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	MKK2	P32491	506 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	MOT2	P34909	587 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	EEB1	Q02891	456 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	TMA46	Q12000	345 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	NFS1	P25374	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	UGA2	P38067	497 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	MSH4	P40965	878 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	TYW3	P53177	273 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	YGR053C	P53234	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	NAB6	Q03735	1134 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
MRH4	YGL064C	PTC5	Q12511	572 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	TRP2	P00899	507 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	TAF13	P11747	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	MCM7	P38132	845 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	ALG3	P38179	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	YLR225C	Q05948	407 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	ESC2	Q06340	456 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	GIC2	Q06648	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	AFG2	P32794	780 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	SKN7	P38889	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	ABD1	P32783	436 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	YKL069W	P36088	180 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	HSE1	P38753	452 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	YLR257W	Q06146	321 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	AOS1	Q06624	347 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	OPI10	Q08202	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
MRH4	YGL064C	MLS1	P30952	554 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	GPB2	P39717	880 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	EAR1	Q03212	550 aa		4.9	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
MRH4	YGL064C	INO1	P11986	533 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	COQ2	P32378	372 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	SMY2	P32909	740 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YKL133C	P36066	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	QNS1	P38795	714 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	NPR2	P39923	615 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YPL034W	Q03083	165 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	TPP1	Q03796	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	RKM2	Q03942	479 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	SPO20	Q04359	397 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	SSF2	Q12153	453 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	GRX1	P25373	110 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	LYP1	P32487	611 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	NNK1	P36003	928 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	CNN1	P43618	361 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.89	□□□□□ -1.63	not detected
MRH4	YGL064C	VPS53	P47061	822 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	CHS2	P14180	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	KIP1	P28742	1111 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YKR075C	P36155	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	SEA4	P38164	1038 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	SAF1	P38352	637 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YGL176C	P46945	554 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YJL045W	P47052	634 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	SPT7	P35177	1332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YML133C	Q03099	1374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YLL067C	Q07888	1374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YLL066C	Q99208	1374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YRF1-3	P0CX14	1859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YRF1-7	P0CX15	1859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YRF1-6	P53819	1859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	DBP5	P20449	482 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	MMM1	P41800	426 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	NNF1	P47149	201 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	ENT3	P47160	408 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	CTH1	P47976	325 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	ALT1	P52893	592 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YGR130C	P53278	816 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	SPO21	Q12411	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	SIR4	P11978	1358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	FKS3	Q04952	1785 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YKL107W	P34251	309 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
MRH4	YGL064C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	YER152C	P10356	443 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	GRX4	P32642	244 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MRH4	YGL064C	KAE1	P36132	386 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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