RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000324444.7

SYNE4-201, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 5 BASIC

Gene SYNE4, Length 1,354 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-201ENST00000324444 PIGBQ92521 554 aa23.09■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 SMC4Q9NTJ3 1288 aa23.09■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa23.08■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 C8orf58Q8NAV2 365 aa23.08■■□□□ 1.29
SYNE4-201ENST00000324444 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.07■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 QSER1Q2KHR3 1735 aa23.06■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 BCAR3O75815 825 aa23.06■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 PDE3AQ14432 1141 aa23.06■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 SGIP1Q9BQI5 828 aa23.06■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 TMOD3Q9NYL9 352 aa23.06■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa23.06■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 KCPQ6ZWJ8 1503 aa23.05■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 TTC5Q8N0Z6 440 aa23.04■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 SLC16A10Q8TF71 515 aa23.04■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 SSH1Q8WYL5 1049 aa23.04■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.04■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.03■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa23.03■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 TSPYL6Q8N831 410 aa23.03■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 C5P01031 1676 aa23.02■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 KCNQ3O43525 872 aa23.02■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF790Q6PG37 636 aa23.02■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 ARHGAP45Q92619 1136 aa23.02■■□□□ 1.28
SYNE4-201ENST00000324444 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 ARXQ96QS3 562 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 STK31Q9BXU1 1019 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 MSH5O43196 834 aa23.01■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 SLC39A6Q13433 755 aa23■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 KRT24Q2M2I5 525 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 SYT17Q9BSW7 474 aa22.99■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 PLIN1O60240 522 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 POLD1P28340 1107 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 SIK1P57059 783 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 AAMPQ13685 434 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.98■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 ATG3Q9NT62 314 aa22.97■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 C4BP0C0L5 1744 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 AK7Q96M32 723 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 PTPRCP08575 1304 aa22.96■■□□□ 1.27
SYNE4-201ENST00000324444 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 PPP4R2Q9NY27 417 aa22.95■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 LINC00116Q8NCU8 138 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 TJP1Q07157 1748 aa22.94■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 ATP6V1AP38606 617 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 FLAD1Q8NFF5 587 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.93■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 SLC4A2P04920 1241 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 ITPK1Q13572 414 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 MSL1Q68DK7 614 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 AMIGO3Q86WK7 504 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 KLHL34Q8N239 644 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 CACNA1FO60840 1977 aa22.92■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 PHF14O94880 888 aa22.9■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 SMIM5Q71RC9 77 aa22.9■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.89■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SYNE4-201ENST00000324444 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 TRIM27P14373 513 aa22.89■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 CRBNQ96SW2 442 aa22.89■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 UBR3Q6ZT12 1888 aa22.88■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa22.88■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.88■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 ERBB4Q15303 1308 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 UTRNP46939 3433 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 GNPATO15228 680 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 C20orf194Q5TEA3 1177 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 HYPKQ9NX55 129 aa22.87■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 YY1P25490 414 aa22.86■■□□□ 1.25
SYNE4-201ENST00000324444 SSFA2P28290 1259 aa22.86■■□□□ 1.25
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