RNA–Protein interactions for RNA: YOR317W

FAA1, Transcript of Long chain fatty acyl-CoA synthetase, yeast

Gene FAA1, Length 2,103 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
FAA1	YOR317W	YKL069W	P36088	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	POP2	P39008	433 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	HUL4	P40985	892 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	ZDS2	P54786	942 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	TOS4	Q06266	489 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	ESC2	Q06340	456 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	HNM1	P19807	563 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	KIP2	P28743	706 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	PLC1	P32383	869 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	PEP7	P32609	515 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	RSC30	P38781	883 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	VPS8	P39702	1274 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	SGM1	P47166	707 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	KXD1	P53158	218 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	CWC24	P53769	259 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	ALO1	P54783	526 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.56	□□□□□ -1.68	not detected
FAA1	YOR317W	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	YLL054C	Q12244	843 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	TRP5	P00931	707 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	CYC8	P14922	966 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	MRPL25	P23369	157 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	DAL80	P26343	269 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	DBF20	P32328	564 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	EUG1	P32474	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	TAF5	P38129	798 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	ROG3	P43602	733 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	RET2	P43621	546 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	YJL055W	P47044	245 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	NAN1	Q02931	896 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	TAF8	Q03750	510 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	SGD1	Q06132	899 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	AOS1	Q06624	347 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	RSC58	Q07979	502 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	PRI2	P20457	528 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	PET112	P33893	541 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	VTC4	P47075	721 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	CTR9	P89105	1077 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	HOT1	Q03213	719 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	JIP4	Q03361	876 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	PSR2	Q07949	397 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	ESC8	Q08119	714 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	PCL8	Q08966	492 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	OSH2	Q12451	1283 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	ENT1	Q12518	454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	IDI1	P15496	288 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	BCD1	P38772	366 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
FAA1	YOR317W	RIC1	P40395	1056 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	ROM1	P53046	1155 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	PEX14	P53112	341 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	LDB19	Q12502	818 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	REC107	P21651	314 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	CHS3	P29465	1165 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	HSP78	P33416	811 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	ORC6	P38826	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	FMP10	P40098	244 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	VPS4	P52917	437 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	YNL035C	P53962	389 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	RCM1	P53972	490 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	TFB2	Q02939	513 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	OPI10	Q08202	246 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	LAP2	Q10740	671 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	MMP1	Q12372	583 aa		4.54	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	CAN1	P04817	590 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	CDC60	P26637	1090 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	PTH2	P34222	208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	YER034W	P40022	185 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	YIL166C	P40445	542 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	TMA108	P40462	946 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	ENV9	Q08651	330 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	YIL177C	P40434	1758 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	YJL225C	P40889	1758 aa		4.53	□□□□□ -1.68
FAA1	YOR317W	PET111	P08468	800 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAA1	YOR317W	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FAA1	YOR317W	PTP2	P29461	750 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAA1	YOR317W	TFB1	P32776	642 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAA1	YOR317W	SCT1	P32784	759 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAA1	YOR317W	DUT1	P33317	147 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAA1	YOR317W	DHR2	P36009	735 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
FAA1	YOR317W	KTR4	P38131	464 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAA1	YOR317W	HSM3	P38348	480 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAA1	YOR317W	YHL041W	P38730	149 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAA1	YOR317W	HLJ1	P48353	224 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAA1	YOR317W	GYP7	P48365	746 aa		4.52	□□□□□ -1.69
FAA1	YOR317W	SHE10	P53075	577 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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