RNA–Protein interactions for RNA: YJL011C

RPC17, Transcript of RNA polymerase III subunit C17, yeast

Gene RPC17, Length 486 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPC17	YJL011C	GNT1	Q12096	491 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	YOR131C	Q12486	218 aa		6.08	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	RET1	P22276	1149 aa	Known RBP	6.07	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	NFS1	P25374	497 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	KIP1	P28742	1111 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	NNK1	P36003	928 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	RNH70	P53331	553 aa		6.07	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	SBP1	P10080	294 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	YER152C	P10356	443 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	YCK2	P23292	546 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	RSC6	P25632	483 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.06	□□□□□ -1.44	not detected
RPC17	YJL011C	PBY1	P38254	753 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	YJL045W	P47052	634 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	ALT1	P52893	592 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	FLC1	Q08967	793 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	YPL260W	Q08977	551 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	SPO21	Q12411	609 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	YPR053C	Q6Q5F3	151 aa		6.06	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	SLN1	P39928	1220 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	YGR125W	P53273	1036 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	EAR1	Q03212	550 aa		6.05	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	TIM23	P32897	222 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	AKR1	P39010	764 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	ERP6	P53198	216 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	TPP1	Q03796	238 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	UBX5	Q06682	500 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	SPO75	Q07798	868 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	OSH2	Q12451	1283 aa		6.04	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	CIT1	P00890	479 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	SNF7	P39929	240 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	ALG12	P53730	551 aa		6.03	□□□□□ -1.44
RPC17	YJL011C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	ARE1	P25628	610 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	PPG1	P32838	368 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	PNT1	P38969	423 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	ALR2	P43553	858 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	OSW7	P43611	510 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	EAF1	Q06337	982 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	SPP382	Q06411	708 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	GIC2	Q06648	383 aa		6.02	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	ERR1	P0CX10	437 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	ERR2	P0CX11	437 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	GAL11	P19659	1081 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	NAM7	P30771	971 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	SKN7	P38889	622 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	NUP82	P40368	713 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	YFL054C	P43549	646 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	YMR187C	Q03236	431 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	TAF8	Q03750	510 aa		6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	CAN1	P04817	590 aa		6	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	HBS1	P32769	611 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	SPC42	P36094	363 aa		6	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	6	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	MXR1	P40029	184 aa		6	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	UBP3	Q01477	912 aa	Known RBP RIP-Chip data	6	□□□□□ -1.45	not detected
RPC17	YJL011C	MCA1	Q08601	432 aa		6	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	YSC84	P32793	468 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	PGM1	P33401	570 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	BRN1	P38170	754 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.99	□□□□□ -1.45	not detected
RPC17	YJL011C	RTA1	P53047	317 aa		5.99	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.99	□□□□□ -1.45	not detected
RPC17	YJL011C	SNF5	P18480	905 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	BET3	P36149	193 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	TAT1	P38085	619 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	CCC2	P38995	1004 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	DOS2	P54858	310 aa		5.98	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	PHO8	P11491	566 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	SLA2	P33338	968 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	GGA2	P38817	585 aa	Known RBP	5.97	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	MMM1	P41800	426 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.97	□□□□□ -1.45	RIP-Chip
RPC17	YJL011C	YDR306C	Q06640	478 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	YVC1	Q12324	675 aa		5.97	□□□□□ -1.45
RPC17	YJL011C	SAM35	P14693	329 aa		5.96	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	SAF1	P38352	637 aa		5.96	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	TNA1	P53322	534 aa		5.96	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	DUS3	Q06053	668 aa	Known RBP	5.96	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	ACM1	Q08981	209 aa		5.96	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	YLR125W	Q12138	136 aa		5.96	□□□□□ -1.46
RPC17	YJL011C	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.96	□□□□□ -1.46

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