Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
J3KRW8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
J3KRW8 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
J3KRW8 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
J3KRW8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
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