Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.1
J3KRW8 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
J3KRW8 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
J3KRW8 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
J3KRW8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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