Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HIF1AQ16665 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HIF1AQ16665 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
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