Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y8

SEC23IP, SEC23-interacting protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,000 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23IPQ9Y6Y8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SEC23IPQ9Y6Y8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SEC23IPQ9Y6Y8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC23IPQ9Y6Y8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC23IPQ9Y6Y8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms