Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRAPPC1Q9Y5R8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TRAPPC1Q9Y5R8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TRAPPC1Q9Y5R8 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TRAPPC1Q9Y5R8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms