Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5G2

PCDHGB2, Protocadherin gamma-B2, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHGB2Q9Y5G2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PCDHGB2Q9Y5G2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PCDHGB2Q9Y5G2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PCDHGB2Q9Y5G2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PCDHGB2Q9Y5G2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCDHGB2Q9Y5G2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms