Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMED5Q9Y3A6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMED5Q9Y3A6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TMED5Q9Y3A6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMED5Q9Y3A6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMED5Q9Y3A6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1141.9 ms