Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH1Q9Y2L9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRCH1Q9Y2L9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH1Q9Y2L9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH1Q9Y2L9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH1Q9Y2L9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH1Q9Y2L9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH1Q9Y2L9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRCH1Q9Y2L9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRCH1Q9Y2L9 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRCH1Q9Y2L9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LRCH1Q9Y2L9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LRCH1Q9Y2L9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms