Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G0

EFR3B, Protein EFR3 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3BQ9Y2G0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
EFR3BQ9Y2G0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
EFR3BQ9Y2G0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
EFR3BQ9Y2G0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EFR3BQ9Y2G0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EFR3BQ9Y2G0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63 ms