Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y234

LIPT1, Lipoyltransferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT1Q9Y234 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
LIPT1Q9Y234 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
LIPT1Q9Y234 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIPT1Q9Y234 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LIPT1Q9Y234 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
LIPT1Q9Y234 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms