Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQD0

SCN8A, Sodium channel protein type 8 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN8AQ9UQD0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SCN8AQ9UQD0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCN8AQ9UQD0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SCN8AQ9UQD0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SCN8AQ9UQD0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SCN8AQ9UQD0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.4 ms