Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPY8

MAPRE3, Microtubule-associated protein RP/EB family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAPRE3Q9UPY8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
MAPRE3Q9UPY8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MAPRE3Q9UPY8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MAPRE3Q9UPY8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MAPRE3Q9UPY8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms