Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPN7

PPP6R1, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP6R1Q9UPN7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC38.01■■■■□ 3.68
PPP6R1Q9UPN7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PPP6R1Q9UPN7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PPP6R1Q9UPN7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PPP6R1Q9UPN7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.94■■■■□ 3.66
PPP6R1Q9UPN7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PPP6R1Q9UPN7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PPP6R1Q9UPN7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PPP6R1Q9UPN7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PPP6R1Q9UPN7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PPP6R1Q9UPN7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
PPP6R1Q9UPN7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
PPP6R1Q9UPN7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC37.88■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PPP6R1Q9UPN7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC37.82■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PPP6R1Q9UPN7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC37.74■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PPP6R1Q9UPN7 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
PPP6R1Q9UPN7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
PPP6R1Q9UPN7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PPP6R1Q9UPN7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PPP6R1Q9UPN7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
PPP6R1Q9UPN7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC37.68■■■■□ 3.62
PPP6R1Q9UPN7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PPP6R1Q9UPN7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PPP6R1Q9UPN7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PPP6R1Q9UPN7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PPP6R1Q9UPN7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PPP6R1Q9UPN7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
PPP6R1Q9UPN7 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms