Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNN4

GTF2A1L, TFIIA-alpha and beta-like factor, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1LQ9UNN4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GTF2A1LQ9UNN4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GTF2A1LQ9UNN4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GTF2A1LQ9UNN4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
GTF2A1LQ9UNN4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms