Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN79

SOX13, Transcription factor SOX-13, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX13Q9UN79 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SOX13Q9UN79 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SOX13Q9UN79 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SOX13Q9UN79 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SOX13Q9UN79 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SOX13Q9UN79 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms