Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKT9

IKZF3, Zinc finger protein Aiolos, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKZF3Q9UKT9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
IKZF3Q9UKT9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IKZF3Q9UKT9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
IKZF3Q9UKT9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IKZF3Q9UKT9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms