Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA9

PTBP2, Polypyrimidine tract-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTBP2Q9UKA9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PTBP2Q9UKA9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTBP2Q9UKA9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PTBP2Q9UKA9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTBP2Q9UKA9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTBP2Q9UKA9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms