Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1U0

ZNRD1, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA12, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.94
ZNRD1Q9P1U0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ZNRD1Q9P1U0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ZNRD1Q9P1U0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ZNRD1Q9P1U0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms