Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR8

RDH8, Retinol dehydrogenase 8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH8Q9NYR8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RDH8Q9NYR8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RDH8Q9NYR8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
RDH8Q9NYR8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
RDH8Q9NYR8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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