Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVC6

MED17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED17Q9NVC6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MED17Q9NVC6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MED17Q9NVC6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
MED17Q9NVC6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MED17Q9NVC6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms