Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HOMER3Q9NSC5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HOMER3Q9NSC5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HOMER3Q9NSC5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HOMER3Q9NSC5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HOMER3Q9NSC5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms