Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TMPRSS4Q9NRS4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMPRSS4Q9NRS4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TMPRSS4Q9NRS4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TMPRSS4Q9NRS4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms