Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG0

CHRAC1, Chromatin accessibility complex protein 1, humanhuman

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Length 131 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRAC1Q9NRG0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRAC1Q9NRG0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRAC1Q9NRG0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRAC1Q9NRG0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRAC1Q9NRG0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHRAC1Q9NRG0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRAC1Q9NRG0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHRAC1Q9NRG0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHRAC1Q9NRG0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CHRAC1Q9NRG0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CHRAC1Q9NRG0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CHRAC1Q9NRG0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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