Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPP4

NLRC4, NLR family CARD domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC4Q9NPP4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NLRC4Q9NPP4 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
NLRC4Q9NPP4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
NLRC4Q9NPP4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
NLRC4Q9NPP4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
NLRC4Q9NPP4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms