Protein–RNA interactions for Protein: Q9N2J8

HERV-H_2q24.1 provirus ancestral Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9N2J8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9N2J8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9N2J8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9N2J8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Q9N2J8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9N2J8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9N2J8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9N2J8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9N2J8 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Q9N2J8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9N2J8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9N2J8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Q9N2J8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9N2J8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9N2J8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9N2J8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Q9N2J8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9N2J8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Q9N2J8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9N2J8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9N2J8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9N2J8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9N2J8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9N2J8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9N2J8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Q9N2J8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9N2J8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9N2J8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Q9N2J8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9N2J8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9N2J8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Q9N2J8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9N2J8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Q9N2J8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9N2J8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9N2J8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Q9N2J8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9N2J8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Q9N2J8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9N2J8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9N2J8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9N2J8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9N2J8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Q9N2J8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9N2J8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9N2J8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9N2J8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9N2J8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9N2J8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9N2J8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9N2J8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9N2J8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Q9N2J8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9N2J8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9N2J8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9N2J8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9N2J8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9N2J8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9N2J8 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9N2J8 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9N2J8 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9N2J8 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Q9N2J8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Q9N2J8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9N2J8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Q9N2J8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9N2J8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9N2J8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9N2J8 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9N2J8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Q9N2J8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9N2J8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9N2J8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9N2J8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9N2J8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9N2J8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9N2J8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9N2J8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9N2J8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Q9N2J8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9N2J8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9N2J8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9N2J8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Q9N2J8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9N2J8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9N2J8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9N2J8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9N2J8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9N2J8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Q9N2J8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9N2J8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9N2J8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9N2J8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9N2J8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9N2J8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Q9N2J8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Q9N2J8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9N2J8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Q9N2J8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Q9N2J8 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms