Protein–RNA interactions for Protein: Q9H254

SPTBN4, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 4, humanhuman

Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN4Q9H254 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SPTBN4Q9H254 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.6
SPTBN4Q9H254 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SPTBN4Q9H254 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SPTBN4Q9H254 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms