Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I9

LRRC27, Leucine-rich repeat-containing protein 27, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC27Q9C0I9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC27Q9C0I9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC27Q9C0I9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC27Q9C0I9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
LRRC27Q9C0I9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC27Q9C0I9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC27Q9C0I9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC27Q9C0I9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
LRRC27Q9C0I9 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
LRRC27Q9C0I9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
LRRC27Q9C0I9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
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LRRC27Q9C0I9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
LRRC27Q9C0I9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
LRRC27Q9C0I9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
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LRRC27Q9C0I9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC27Q9C0I9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC27Q9C0I9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC27Q9C0I9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
LRRC27Q9C0I9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LRRC27Q9C0I9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
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LRRC27Q9C0I9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
LRRC27Q9C0I9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
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LRRC27Q9C0I9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
LRRC27Q9C0I9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
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LRRC27Q9C0I9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
LRRC27Q9C0I9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
LRRC27Q9C0I9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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