Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM3Q9BZL3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM3Q9BZL3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SMIM3Q9BZL3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM3Q9BZL3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM3Q9BZL3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SMIM3Q9BZL3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
SMIM3Q9BZL3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SMIM3Q9BZL3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SMIM3Q9BZL3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SMIM3Q9BZL3 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SMIM3Q9BZL3 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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