Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PARD6BQ9BYG5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PARD6BQ9BYG5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PARD6BQ9BYG5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARD6BQ9BYG5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PARD6BQ9BYG5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PARD6BQ9BYG5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms