Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CADM1Q9BY67 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CADM1Q9BY67 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CADM1Q9BY67 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CADM1Q9BY67 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CADM1Q9BY67 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms