Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRT7

LINC00467, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00467, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00467Q9BRT7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
LINC00467Q9BRT7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
LINC00467Q9BRT7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LINC00467Q9BRT7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms