Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ75

CMSS1, Protein CMSS1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMSS1Q9BQ75 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMSS1Q9BQ75 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CMSS1Q9BQ75 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CMSS1Q9BQ75 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CMSS1Q9BQ75 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms