Protein–RNA interactions for Protein: Q99576

TSC22D3, TSC22 domain family protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC22D3Q99576 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TSC22D3Q99576 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TSC22D3Q99576 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TSC22D3Q99576 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TSC22D3Q99576 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TSC22D3Q99576 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms