Protein–RNA interactions for Protein: Q96SD1

DCLRE1C, Protein artemis, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 692 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1CQ96SD1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
DCLRE1CQ96SD1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
DCLRE1CQ96SD1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DCLRE1CQ96SD1 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
DCLRE1CQ96SD1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms