Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC138Q96M89 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CCDC138Q96M89 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CCDC138Q96M89 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CCDC138Q96M89 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms