Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
SAMD8Q96LT4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SAMD8Q96LT4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SAMD8Q96LT4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SAMD8Q96LT4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms