Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ0

SGTB, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein beta, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTBQ96EQ0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGTBQ96EQ0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SGTBQ96EQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SGTBQ96EQ0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGTBQ96EQ0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SGTBQ96EQ0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SGTBQ96EQ0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGTBQ96EQ0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGTBQ96EQ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SGTBQ96EQ0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SGTBQ96EQ0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SGTBQ96EQ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SGTBQ96EQ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms