Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
YIPF6Q96EC8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
YIPF6Q96EC8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
YIPF6Q96EC8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YIPF6Q96EC8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
YIPF6Q96EC8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 410.3 ms